突然，受到从时空门出现的敌人袭击的宝太郎及其同伴们。被迫陷入苦战之中，察觉到敌人从未来传送过来…！为了守护现在与未来，宝太郎与凛音穿越时空前往荒废的未来。在那里的是昔日从困境中拯救宝太郎等人，掌握着故事的关键，“20年后的宝太郎”，假面骑士歌查德黎明骑士的身姿。

　　寻找101体〈Chemi〉！　　新骑士是操纵卡片的〈炼金术师〉！！　　【假面骑士Gotchard】9月3日诞生！！　　101张卡片进行形态变换！？　　高中生・一之濑宝太郎，前所未见的冒险故事。　　围绕著人工生命体Chemi的战斗开始！！

　　令和骑士？还早100年呢！　　镶嵌着历代假面骑士的驾驭凯米卡，以及假面骑士雷杰德的身姿，让人联想到某个与卡相关的假面骑士，那么假面骑士雷杰德究竟是何方神圣?