故事以前作《科学小飞侠Crowds》的后续剧情展开。距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不明人士的袭击，GATCHAMAN的全新战斗就此揭开序幕。

故事发生在遥远的未来时代，日本财政陷入了巨大的危机之中，就在国家即将崩溃之时，一个名为“SovereignWealthFund”的金融机构出现，成功的挽救了摇摇欲坠的日本。尽管经济危机得到了缓解，但城市却因长久以来的缺乏管理而陷入了混乱，失业率、自杀率和犯罪率急速上升。余贺公麿（内山昂辉配音）的母亲

　　故事发生在2015年的东京立川市，极度发达的网络科技让手机和社交网络成为了人们生活中不可或缺的一部分，与此同时，被称为“MESS”的网络漏洞亦常常给用户带来意想不到的麻烦。为了应对MESS造成的骚乱，一支名为“Gatchaman”的特别行动小组成立了，其中的成员，都是拥有着特殊能力的异能者。　　

　　本片以湘南的江之岛为舞台，围绕岛上四个少年真田雪、春、宇佐美夏树、阿基拉·安格鲁卡鲁·山田展开。高中生真田雪（逢坂良太 配音）是个转校生，他不善于与人交往，还经常会因为紧张而露出可怕的表情。春（入野自由 配音），自称是从宇宙来地球钓鱼的外星人，他不仅擅自住在雪家，还邀请雪钓鱼。没有一个朋友的雪，

故事以前作《科学小飞侠Crowds》的后续剧情展开。距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不明人士的袭击，GATCHAMAN的全新战斗就此揭开序幕。